JWei's Blog

现代分子生物学 思维导图 --- 蛋白质合成之遗传密码。

现代分子生物学 思维导图 --- 蛋白质合成之 'tRNA'。

现代分子生物学 思维导图 --- 蛋白质合成之。

现代分子生物学 思维导图 --- 蛋白质合成之蛋白质的生物合成。

现代分子生物学 思维导图 --- 原核生物基因表达调控之转录后水平的调控。

现代分子生物学 思维导图 --- 原核生物基因表达调控之转录水平的调控。

现代分子生物学 思维导图 --- 原核生物基因表达调控之基因表达调控。

现代分子生物学 思维导图 --- 原核生物基因表达调控之原核细胞转录调控的操纵子学说。

简单介绍

3D-DNA 一种从头组装管道，从一系列迭代开始，其目标是消除输入 scaffolds 中的错误连接。每个步骤都从一个 scaffolds 池开始（最初，这个池是一组输入 scaffold 本身）。scaffold 算法用于对这些 scaffold 进行排序和定相。接着应用错误连接校正算法来检测 scaffold 池中的错误，从而创建一个编辑后的 scaffold 池。最后，将编辑后的 scaffold 池用作错误连接校正算法进行下一次迭代的输入。这些迭代的最终效果是再不删除正确组装的序列的情况下可靠地检测输入 scaffold 中的错误连接。此过程完整后，将 scaffold 算法应用于修改后的输入 scaffold。

HiC-Pro 用于 HiC 数据处理的一种管道工具，是一款高效的 Hi-C 数据分析软件。最终 HiC-Pro 可以利用相位数据来构建 allele-specific contact maps。