JWei's Blog

Hexo + hexo-theme-next 配置 Blog

依托于 Github Page 创建个人博客，采用 hexo-theme-next 主题，截至 2022-03-10 next主题更新至 8.10.1，记录一下本次 Blog 搭建过程

背景

单倍型基因组组装方法是针对于动植物基因组组装提出的更为精确的组装策略，二倍体基因组同时拥有来自父本与母本的基因型，存在复杂的等位基因变异，极大地提高了二倍型基因组的组装难度。也就是说我们如要完整组装二倍型基因组，需要将二倍型基因组进行两次单倍型基因组组装，从而精准的定位到染色体水平。目前，大多数二倍体基因组组装忽略了同源染色体之间的差异，从而将基因组组装成一个伪单倍体序列，这将会对之后基因注释产生很多不确定因素以及得到不准确的生物学解释。想要得到二倍体精确的单倍体基因组，从测序样本入手是一种常见的策略。我们可以通过不断近交以得到纯合双单倍体基因型，便可组装得到纯合基因组；又或者提供物种的配子进行测序，亦能得到准确的单倍型基因组；又或者在测序前分离单个染色体，从而实现单个单倍型基因组的测序和组装。

查看当前目录下哪个文件占用空间最大？

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du -h --max-depth=1
# 查看服务器磁盘空间使用情况
df -h

切割字符串

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awk 'NR==1' seq.fasta > seq_need.fasta && sed -n '2,$p' seq.fasta | xargs | sed 's/ //g' | cut -c -start >> seq_need.fasta && sed -n '2,$p' seq.fasta | xargs | sed 's/ //g' | cut -c end- >> seq_need.fasta
# 注意 start > 1;
# 上面的命令直接提取 seq.fasta 103-end碱基到seq_need.fasta文件中

当我们利用 Hexo + Github Page 部署 Blog 之后，在更新博客时，需要常常用到 hexo 命令，故在这里集中整理一下

Hexo 官方也出了中英文的教程文档，如有需要，可自行前去学习

• Links:

  • zh-CN：文档 | Hexo
  • en-US：Documentation | Hexo

期待已久的个人博客终于有了个模样（虽然是套用大佬的 Theme），还是耐不住想要在这里多记录一点。