基于 De Bruijn Graph 的序列比对算法
Introduction
传统的序列比对大多都是线性的,在一定程度上忽略了基因组的整体结构;而基于
De Bruijn Graph
的序列比对算法则在结构的基础上完成与参考基因组的比对。
BAM 文件解读
Introduction
了解生信的都知道,BAM
是一种测序数据比对信息存储的一种文件格式,类似的还有 SAM
格式;可以这么理解:BAM
是 SAM
经过压缩之后的一种文件格式,其压缩率可以减少很大的同级别的存储空间。