Python3 代码编写习惯 - 2
Introduction
记录个人 Python 编程的一些小习惯。
Linux-Shell 编程技巧学习 - 2
Introduction
Shell 脚本的执行逻辑：
准确来讲，
shell会先将脚本写入内存进行执行；这样对脚本进行修改时，便不会生效；那么在流程代码编写中，我们可以尽量将可能需要修改的代码其中放在另一个外置的脚本中；只需要额外添加一个轮询脚本便可。
在轮询脚本中导入前面外置的脚本，便可实现每次导入脚本时，都会重新将该脚本写入
这样便可在不用重投轮询脚本的前提下对修改后的主脚本生效
高通量测序知识学习
Introduction
高通量测序(
high-throughput sequencing,HTS)，即下一代测序(next generation sequencing,NGS)，又称为大规模平行测序(massively parallel sequencing,MPS)
1. 高通量测序技术的特点
操作步骤多，程序复杂
SGE 集群作业调度管理系统
Introduction
SGE(Sun Grid Engine) ，Sun
网格引擎 是一种来自于SUN
Microsystem的分布式资源管理和调度系统，它用来在基于UNIX的计算环境中优化软件和硬件资源的使用。SGE能用于查找资源池内的闲置资源并利用这些资源；它同样用于通常的一些事务中，例如管理和调度作业到可用资源中。
Samtools 的使用
Introduction
用于查看和处理 SAM 和 BAM 文件；SAM 文件较 BAM 文件大，BAM 文件是 SAM 文件的二进制格式文件，空间占用小，且用于计算时的速度也会大大提升。
SAM 文件可以保留 reads 到参考基因组序列的比对信息；主要由两部分组成：头部（header section）和比对结果部分（alignment section）
Linux 快捷命令学习
Introduction
Linux
对于开发人员来讲，是一款必学的操作系统。且现服务器端基本都是部署于Linux；常见的有Red Hat、CentOS、Ubuntu......
熟悉Linux系统下诸多命令的常用用法，在服务器端进行生产时，将会事半功倍；往往一个简单的操作，可以使用很多自己熟悉的方式进行实现；Python、Perl、R可能都可以实现，但是在Linux操作系统下，其配套的shell不会更香吗？Shell一行代码能解决的事情，Python却要一个脚本，怎么想都差点意思。